KNIME
こんばんは，@PKです. Mishima.syk#16に参加しました． connpass.com オンラインは初でしたが楽しく発表・議論することができました．ありがとうございました． speakerdeck.com 発表のスライドはspeakerdeckに上げました． 最初はSlideShareにあげようと思…
こんにちは，@PKです. 初めに プリズナートレーニングとは workoutを記録するKNIME workflow workflow概要 workout registration workflow twitter post workflow workout visualization 終わりに 初めに みなさん筋トレ好きですか？ 最近は在宅勤務だったの…
こんにちは，@PKです. 動画コンテンツって、意外と時間を食うのでなかなか気持ちに余裕がないと見れない（見る気にならない）のですが、GWは気持ちに余裕があったので、YoutbeのKNIME TVの最近のWebinar動画を何本か見て、KNIME Hubで関連するworkflowをダウ…
こんにちは，@PKです. はじめに Seven Techniques for Data Dimensionality Reduction Missing Values Ratio Low Variance Filter High Correlation Filter Random Forests / Ensemble Trees Principal Component Analysis (PCA) Backward Feature Eliminati…
こんにちは，@PKです. 今日はマルチチャンネル画像データをタイル状に並べるWorkflow②を紹介します． はじめに Workflowの紹介 チャンネルごとにループ処理を行い，タイル画像を作成 チャンネルごとのタイル画像を1枚のマルチチャンネル画像に変換 最後に は…
こんにちは，@PKです. 今日はマルチチャンネル画像データをタイル状に並べるWorkflow①を紹介します． はじめに Workflowの概要 画像ファイルの読み込み ファイル名で画像データを並び替え 画像の特定部分を切り抜き 各チャンネルごとに分解 最後に はじめに …
こんばんは，@PKです. 今回は化合物処理の時系列データから変化量を計算するKNIME Workflowについて紹介します． はじめに KNIME Workflowの概要 「Column Rename (Regex)」を使用してカラム名を変更 「Lag Column」で変化量を計算する 「Math Formula」で変…
こんにちは，@PKです. 今回は本当に初心者のためのKNIMEインストール方法について紹介します． KNIME始めてみたいけど，インストールどうやるのだろう，という方向けの内容になっています． バージョン管理も考慮したインストール方法の詳しい解説は下記にも…
こんばんは，@PKです. これまでブログで紹介してきたように，KNIMEはGUIの画面上でプログラムを実行するものですが，作り込んだWorkflowを定期的に実行する場合に，毎回KNIMEを立ち上げてWorkflowを開いて実行するのは少しめんどくさいですよね． 今回はGUI…
こんばんは，@PKです. これまでk-meansや階層型クラスタリングなどのでクラスター分析について紹介しました． www.t-kahi.com www.t-kahi.com 今回はKNIMEでDBSCANクラスリングについて紹介します． DBSCANについて DBSCAN サンプルデータ作成 「DBSCAN」ノ…
こんばんは，@PKです. 前回KNIMEでクラスタリング(1)でk-meansでクラスター分析について紹介しました． www.t-kahi.com 今回はKNIMEでの階層型クラスリングについて紹介します． 階層型クラスタリングについて 階層型クラスタリング サンプルデータ作成 「Hi…
こんばんは，@PKです. クラスター分析といえば，階層型クラスタリングやk-meansなどが有名かと思いますが，KNIMEでもクラスター分析に関するノードがいくつか用意されています． 今回はクラスター分析に関するKNIMEノード紹介と，k-meansでクラスター分析を…
こんばんは，@PKです. 前回の記事では，Support Vector Machine (SVM) のKNIME Workflowについて紹介しました． www.t-kahi.com 今回はSVMのKNIME WorkflowをRやPythonのノードを使って行うWorkflowを紹介します． KNIME Workflow概要 「R Learner/Predictor…
こんばんは，@PKです. 以前の記事では，Random Forestについて3回に分けてご紹介し，機械学習の基礎的な手法（テストデータ・学習データの分類，交差検証，パラメーター最適化）をKNIME Workflowで紹介しました． 【KNIME】〈前編〉KNIMEでRandom Forest：「…
こんばんは，@PKです. これまでRandom ForestをKNIMEで行うためのノード紹介やパラメーターの最適化などを紹介してきました． www.t-kahi.com www.t-kahi.com 今回は〈後編〉ということで，これまで〈前編〉〈中編〉でKNIMEの専用ノードで行った処理を，Rのc…
こんばんは，@PKです. 前回の記事では〈前編〉KNIMEでRandom Forestということで，「Random Forest Learner/Predictor」を使って学習モデルの作成やテストデータの予測などを紹介しました． www.t-kahi.com しかし，実際にRandom Forestを行う際は，学習デー…
こんばんは，@PKです. 以前，ブログで「Bootstrap」と「Decision Tree」についてそれぞれ紹介しました． www.t-kahi.com www.t-kahi.com このBootstrap SamplingとDecision Treeを組み合わせた機械学習の手法が「Random Forest」です． 今日は機械学習の手法…
こんばんは，@PKです. 前回，決定木（Decision Tree）をKNIME Workflowで行う手法についてご紹介しました． www.t-kahi.com 今回は，前回ご紹介した決定木のWorkflowを使って，モデルの検証手法である，交差検証（Cross Validation）ノードの紹介をしたいと…
こんばんは，@PKです. 前回の記事では線形判別分析（LDA）のKNIME Workflowをご紹介しました． www.t-kahi.com LDAは複数のクラスのデータを最も良く判別できるように線を引く，というイメージでした． 異なる判別分析の手法として決定木(decision tree)によ…
こんにちは，@PKです. 今日は判別分析の一種である線形判別分析(Linear Discriminant Analysis)のKNIME Workflowについて紹介したいと思います． 線形判別分析(Linear Discriminant Analysis) とは KNIME Workflowの概要 「Linear Discrimination Analysis」…
こんばんは，@PKです. 先日KNIMEで使用できるサンプリングノードに関する紹介をしました． www.t-kahi.com 今日はこの中でも，「Bootstrap sampling」を利用したBootstrap法を使って，母集団の統計量（今回は中央値）のばらつきを出すKNIME Worklowを紹介し…
こんばんは，@PKです. KNIME Workflowでデータのサンプリングをする方法をいくつか調べていたのですが，主に3つのサンプリング手法のノードが提供されているようです． それぞれのノードを使った詳細なWorkflowは別の機会で紹介したいので，今回はそれぞれの…
こんばんは，@PKです. 同僚から相談があり，複数のデータからそれぞれ最小・最大値を含む行を除きたい，と相談があって調べていました． イメージとしては以下の通りで，それぞれの条件のデータから"Cell Count"が最小値・最大値のデータを除いて出力する，…
こんばんは，@PKです. QuickFormノードを使ってPubMed検索ワード入力を行い，PubMed APIで論文アブストラクトを取得するKNIME Workflowの紹介です． Workflowの概要とQuickformについては前編で紹介しております． QuickForm素敵なので，ご覧になっていない…
こんばんは，@PKです. PubMed APIを使って論文の情報をKNIME上で取得する，という内容について以前ブログで紹介しました． 【KNIME】PubMedの検索結果(タイトル・出版年月日・アブストラクト等)をKNIMEを使ってまとめて取得する - t_kahi’s blog 今日は少し…
こんばんは，@PKです. 今日はKNIMEでKolmogorov–Smirnov検定(KS-test)を行うWorkflowを紹介したいと思います． Kolmogorov–Smirnov検定(KS-test)とは KNIMEworkflow概要 まとめ（とおまけ） Kolmogorov–Smirnov検定(KS-test)とは Kolmogorov–Smirnov検定とは…
Hi, I'm @PK. I tried to transpose rows to multiple columns by category. The example below showed the transpose of sample data. To solve this issue , I made KNIME workflow below. First, I read sample data which contains two columns, "compou…
こんにちは，@PKです. 前回は単回帰分析でしたので，今回は重回帰分析編です． www.t-kahi.com 散布図・回帰直線の作成，回帰分析結果を出力し，KNIMEで重回帰分析を行う際はどのノードを使うのが良いかを考えてみます． また，交互作用を考慮した重回帰分析…
こんにちは，@PKです. 今回はKNIMEで単回帰分析を行うWorkflowについて紹介します． 散布図・回帰直線の作成，回帰分析結果を出力し，どのノードを使うのが良いかを考えてみます． KNIME Worlkflowの概要 「R view」で散布図と回帰直線の作成 単回帰分析の回…
こんばんは，@PKです. 今回は，数値データを含む全てのカラムをループで処理するKNIME Workflowについて紹介します． はじめに Workflowの概要 サンプルデータ取得⇒前処理 ループ処理について まとめ はじめに 以前にKNIME Workflowによる実験データの数値処…
