t_kahi’s blog

KNIMEやCellProfiler、創薬に関する記事と,日々のメモです

2019-12-01から1ヶ月間の記事一覧

非臨床段階における低分子創薬の流れについて(基礎)

こんばんは,@PKです. はじめに Target validation Hit discovery process Assay development Defining a hit series Hit-to-lead & Lead optimization phase 最後に reference はじめに 今回のブログでは,「Principles of early drug discovery」という文…

Target-focused phenotypic screeningについて

こんにちは,@PKです. こちらは,創薬アドベントカレンダー(Wet)21日目の記事です. 創薬 (wet) Advent Calendar 2019 - Adventar この記事では,「Target-focused phenotype screening」について,紹介します. Target-based screening & Phenotypic scre…

"Right Target"とは何か;AstraZenecaの5R frameworkから考えるターゲットバリデーション

こんにちは,@PKです. こちらは,創薬アドベントカレンダー(Wet)4日目の記事です. 創薬 (wet) Advent Calendar 2019 - Adventar 創薬アドベントカレンダー1~3日目ではCellProfilerの使い方を紹介しましたが,(創薬Wet記事というよりはCellProfilerの使い…

【CellProfiler】Example pipeline(Fruit fly cells)で画像解析の基礎を学ぶ③:共局在と特徴量の数値計算について

こんにちは,@PKです. こちらは,創薬アドベントカレンダー(Wet)3日目の記事です. 創薬 (wet) Advent Calendar 2019 - Adventar 1日目と2日目の記事は下記になります. 【CellProfiler】Example pipeline(Fruit fly cells)で画像解析の基礎を学ぶ①:画…

【CellProfiler】Example pipeline(Fruit fly cells)で画像解析の基礎を学ぶ②:Neighborhoodに関する特徴量

こんにちは,@PKです. こちらは,創薬アドベントカレンダー(Wet)2日目の記事です. 創薬 (wet) Advent Calendar 2019 - Adventar 1日目にはExample pipeline(Fruit fly cells)で画像解析の基礎を学ぶ①で使用する「Fruit fly cells Pipeline」の概要と,…

【CellProfiler】Example pipeline(Fruit fly cells)で画像解析の基礎を学ぶ①:画像のトリミング

こんばんは,@PKです. 創薬アドベントカレンダー(Wet)1日目の記事です. 創薬 (wet) Advent Calendar 2019 - Adventar 今回は,High Content Analysisの画像解析ツールCellProfilerの使い方について,簡単ではありますが紹介したいと思います. 以前ブログ…