こんにちは，@PKです. 前回のブログでCellProfilerを使って細胞から様々な特徴量を抽出する取り組みを紹介しました．今回はその続きです． t-kahi.hatenablog.com ミトコンドリアや小胞体，ゴルジ体などの細胞小器官のオブジェクト認識と，特徴量の抽出など…

こんにちは，@PKです. mishima.syk13で，CellProfilerで画像解析をしたデータをKNIMEを使って可視化する，という取り組みについて発表する機会をいただけました． 拙い内容でしたが皆さんから意見や感想をいただくことができて本当に勉強になった一日を過ご…

こんばんは，@PKです. 以前，細胞染色の画像データとメタデータ（処理した化合物名，Well番号，プレート番号）を， CellProfilerの「Metadata」モジュールで紐付ける操作の紹介をしました． t-kahi.hatenablog.com このメタデータには，薬理活性化合物の名前…